Di dunia sihir, terdapat teknik-teknik mematikan yang tak dapat diubah dan dikenal sebagai spellblades. Sihir yang langka dan sulit dipahami ini, bersama dengan penggunanya, diselimuti misteri dan hanya dikenal oleh masyarakat karena kematiannya yang mutlak.

Setiap tahun, mekarnya bunga musim semi menandakan masuknya mahasiswa baru ke sekolah sihir prestisius Kimberly. Dengan reaksi kekaguman dan kebingungan, parade yang megah lengkap dengan makhluk-makhluk sihir menyambut pendatang baru di institusi tersebut. Di antara mereka adalah Oliver Horn yang misterius, yang awalnya acuh tak acuh berubah menjadi kekaguman ketika ia melihat sosok aneh—seorang gadis yang mengenakan pakaian aneh dengan pedang Jepang terikat di pinggangnya.

Sejak upacara pembukaan, Oliver menyadari bahwa tidak semua seperti yang terlihat di Kimberly, ketika munculnya labirin, monster, dan ancaman lainnya membahayakan tubuh mahasiswa baru. Nanatsu no Maken ga Shihai Suru mengeksplorasi takdir yang saling terkait dari dua pejuang saat mereka mengungkap kebenaran gelap yang tersembunyi di dalam dinding akademi.